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简介:
近些年,随着生物医学领域的高速发展,以生物信息为代表的大数据科学愈发重要。因此催生了数以千计的各类处理、分析、解读生物医学数据的生物信息软件、工具和数据库。这些工具不断积累的同时,给用户也带来巨大负担,用户很难从海量的数据工具中检索到符合自己研究目的的工具。同时,也缺乏相关对各类软件工具质量评估的一个平台门户。
为此,生信宝库立足于对这些工具和数据库资源进行整理、分类和统计分析,致力于打造专门针对各类生物医药领域相关的软件工具和数据库的整合资源库。 生信宝库旨在服务于生物信息学科发展的同时,为相关领域的研究者提供工具推荐和数据导航,为软件开发者提供分享自己作品的平台。在生信宝库中,用户可以快速地根据自己的研究目的进行相应数据分析工具的检索、浏览及引用。
开发者可以在软件数据库正式发表后,在生信宝库中进行登记、分享和推广自己的工具,并得到用户的反馈和引用。与其他项目不同,生信宝库仅收录已经发表在正规期刊的工具软件和数据库(接受过同行评审),从而确保用户检索到和使用的工具的可靠性。
生信宝库是一个免费、开放的数据共享平台,任何人使用和检索相关的软件和数据库信息,也欢迎开发者加入,共同促进生物信息工具软件社区的发展,打造良好生态。
为解决生信工具选择困难的痛点,生信宝库制定了严格的筛选标准:
1. 必须是已在正规杂志发表的工具;
2. 五年以内发表的新工具;
3. 发表超过五年的工具,相关文章引用数必须超过100。
生信宝库以此标准收集了总计超过10,000个生物信息学工具。
生信宝库采用开放注册的方式以及智能简化的提交流程吸引生物信息学研究人员提交自己开发的工具,并鼓励用户和领域专家对工具进行点评。网站通过工具相关文章的影响因子、文章引用数量、工具页面浏览量、好评度与评论数,共计6项指标给工具综合打分与排名,以此将最优质的生物信息学工具推荐给用户。
参考资料:
生信宝库(BioTreasury)——生物信息学工具的“大众点评”
https://mp.weixin.qq.com/s/Ut2NWWCAJ5_UWZKr4r25Yg
帮助中心
https://biotreasury.rjmart.cn/#/help
BioTreasury: a community-based repository enabling indexing and rating of bioinformatics tools
https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-023-2509-x
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